美国一名高中生完成神仙鱼基因组测序

他说：“尽管我的鱼死掉了，但我希望永久保存它。所以我决定给这条神仙鱼进行基因组测序，希望我可以把这些信息贡献给科学界，同时也向我的宠物表达一点敬意！”

马迪雷迪在加利福尼亚州圣克拉拉的一家社区实验室进行了测序。任何人只要支付一笔小额会员费就可以使用这家实验室里的先进设备。

为了保存鱼的脱氧核糖核酸（DNA），马迪雷迪把他的鱼放在零下80摄氏度的实验室环境中。他花了一个月的时间进行准备并学习如何进行测序。

测序在两个周末完成，使用的是牛津纳米孔公司生产的一台小型测序仪。这类测序仪在DNA分子穿过微孔时读取DNA分子的序列。

牛津纳米孔公司测序仪的精确度略低于其他测序方法，但能够对长度非常大的DNA片段进行测序。这使测序软件更容易通过把全部片段重新拼接好来合成基因组——就像片数少、每片比较大的拼图一样。

马迪雷迪说，分析数据又用了两个月的时间，而且需要学习很多知识。他已经把序列数据放到一个公共数据库里，并且在10月18日发表了一篇短文描述这项工作。

神仙鱼原产亚马孙盆地，已经成为风靡世界的观赏鱼。神仙鱼的基因组没有什么特别之处，与亲缘关系较近的鱼类相似。

马迪雷迪说，测序花费了大约2000美元，而他通过众筹筹集了近1000美元。（编译/卿松竹）

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